Замысел. Как ДНК делает нас теми, кто мы есть, стр. 67

' Отчет [ GWA ] за 2014 г. из PGC для шизофрении, включил 30 000 случаев и выявил более сотни значимых ассоциаций по всему геному »: Рабочая группа по шизофрении Консорциума психиатрической геномики, «Биологические данные из 108 связанных с шизофренией генетических локусов», Nature, 511 (2014) 421- 7. дои: 10.1038/nature13595.

К 2017 году PGC удвоился число случаев и увеличил количество ассоциаций до 155» : Патрик Салливан и др., «Психиатрическая геномика: обновление и повестка дня», Американский журнал психиатрии , 175 (2018) 15-27. doi: 10.1176/appi.ajp.2017.17030283.

' Для биполярного расстройства ... [t] количество значимых совпадений для всего генома увеличилось с нуля до тридцати » : Эли Шталь и др., «Полногеномное ассоциативное исследование идентифицирует 30 локусов, связанных с биполярным расстройством», bioRxiv (2017). дои: https://doi.org/10.1101/173062 .

« Большая депрессия закончилась с медленным началом, только с одним значительным попаданием в анализ GWA из 20 000 случаев »: Роберт А. Пауэр и др., «Полногеномная ассоциация большой депрессии через стратификацию возраста начала: рабочая группа по тяжелому депрессивному расстройству психиатрической геномики. Консорциум», Биологическая психиатрия , 81 (2017): 325-35. doi: 10.1016/j.biopsych.2016.05.010.

« В 2017 году PGC сообщила анализ GWA более 100 000 случаев, в результате которого было выявлено 44 значительных попадания» : Рабочая группа по тяжелому депрессивному расстройству PGC, «Полногеномный анализ ассоциации определяет 44 варианта риска и уточняет генетическую архитектуру большой депрессии», bioRxiv (2017). дои: 10.1101/167577. Напротив, в 2016 г. анализ 75 000 случаев выявил 15 значимых ассоциаций: Craig L. Hyde et al., «Идентификация 15 генетических локусов, связанных с риском глубокой депрессии у лиц европейского происхождения», Nature Genetics, 48 ( 2016 ) : 1031-6. doi: 10.1038/ng.3623. Другое исследование GWA, в котором приняли участие 320 000 человек, добавило людей, которые просто сообщили, что обращались за помощью по поводу депрессии, и нашло 17 совпадений: Дэвид М. Ховард и др., «Ассоциативное исследование генома фенотипов депрессии в британском биобанке (n = 322 580) идентифицирует обогащение». вариантов возбуждающих синаптических путей», bioRxiv (2017). doi.org/10.1101/168732.

« Недавнее исследование гиперактивности GWA с 20 000 случаев сообщило о 12 совпадениях »: Ditte Demontis et al., «Открытие первых локусов значительного риска для всего генома для СДВГ», bioRxiv (2017). дои: https://doi.org/10.1101/145581 .

« В 1993 году. Было обнаружено, что аллель 4 АРОЕ тесно связана с болезнью Альцгеймера» : Элизабет Х. Кордер и др., «Генная доза аллеля аполипопротеина Е типа 4 и риск болезни Альцгеймера у

Late Onset Families', Science , 261 (1993), 921–923. doi : 10.1126/science.8346443.

« Анализ болезни Альцгеймера, проведенный GWA в 2013 г. » : Жан-Шарль Ламберт и др., «Мета-анализ 74 046 человек выявил 11 новых локусов предрасположенности к болезни Альцгеймера», Nature Genetics , 45 (2013): 1452-8. doi: 10.1038/ng.2802.

« По психологическим расстройствам сообщалось о более чем сотне исследований GWA» : Jacqueline MacArthur et al., «Новый каталог NHGRI-EBI опубликованных полногеномных ассоциативных исследований (каталог GWAS)», Nucleic Acids Research , 45 (2017) : doi: 10.1093/нар/gkw1133. ' Размеры обеспечивают большую мощность в исследованиях GWA, чем расстройства, потому что каждый человек имеет значение» . Исследование GWA 50 000 неотобранных индивидуумов может дать возможность обнаружить ассоциацию SNP с признаком, на долю которого приходится 0,1% дисперсии признака. Например, объяснение 0,1 процента дисперсии стоит половины балла IQ в знакомой метрике интеллекта, состоящей из показателей IQ, которые стандартизированы так, чтобы иметь среднее значение 100 и диапазон от 55 до 145 для 99 процентов населения. Но даже этого крошечного эффекта в 0,1% недостаточно. Следующим барьером для преодоления будет 0,01-процентная величина эффекта (например, менее 0,05 балла IQ), для чего потребуются выборки из 500 000 человек. Образцы такого размера находятся в стадии разработки.

Достижение этой вершины в 500 000 человек, которая кажется нелепо большой для психологических исследований, только откроет другую, еще более высокую вершину. Для обнаружения еще меньших эффектов потребуются миллионы образцов.

« Еще одним огромным преимуществом изучения размеров, а не расстройств, является то, что одна и та же выборка может быть использована для изучения многих признаков» . размеры.

Рост и вес являются архетипами количественных признаков. Оба имеют высокую наследуемость: 80% роста и 70% веса. Что касается роста, исследование GWA, в котором приняли участие более 250 000 человек, выявило 679 SNP, в значительной степени связанных с индивидуальными различиями в росте. Что касается веса, исследование GWA, в котором приняли участие более 300 000 человек, выявило 97 совпадений. Величина эффекта этих ассоциаций SNP ничтожно мала, за одним исключением. Что касается веса, то на один SNP приходится 1 процент дисперсии, что является самым большим эффектом, обнаруженным для любого количественного признака. Это SNP в гене FTO , описанный в предыдущей главе. Другие основные SNP для веса объясняют в среднем 0,03% различий между людьми в весе, что соответствует эффекту в 100 граммов. Рост показал несколько более сильные эффекты, хотя самый большой эффект SNP составил всего 0,28%. В среднем на верхние SNP приходится 0,07%, что соответствует влиянию роста на 0,05 см. Эндрю В. Вуд и др., «Определение роли общих вариаций в геномной и биологической архитектуре роста взрослого человека», Nature Genetics, 46 (2014): 1173-86. doi: 10.1038/ng.3097. Адам Э. Локк и др., «Генетические исследования индекса массы тела дают новое представление о биологии ожирения», Nature , 518 (2015): 197-U401. дои: 10.1038/природа14177.

« Первый прорыв был связан с маловероятной переменной: годами образования» : первое исследование GWA о годах обучения было опубликовано в 2013 году: Корнелиус А. Ритвельд и др., «GWAS 126 559 человек идентифицирует генетические варианты, связанные с уровнем образования». Наука , 340 (2013): 1467-71. doi: 10.1126/наука.1235488. Исследование GWA было обновлено в 2016 году: Айсу Окбай и др., «Полногеномное исследование ассоциации идентифицирует 74 локуса, связанных с уровнем образования», Nature , 533 (2016): 539-42. doi: 10.1038/ng.3552. Следующее обновление будет включать в себя выборку размером более 1 миллиона, которая выявила более тысячи значимых ассоциаций: Джеймс Дж. Ли и др., «Открытие генов и полигенное предсказание на основе полногеномного исследования ассоциаций образовательных достижений в 1.1». Million Individual», Nature Genetics , онлайн-публикация Advance (2018). doi: 10.1038/s41588-018-0147-3.

« Многие психологические черты вносят свой вклад в эту наследуемость, например, предыдущие достижения в школе и когнитивные способности, которые коррелируют на 0,5 с количеством лет обучения» : Ева Краполь и др., «Высокая наследуемость образовательных достижений отражает многие генетически обусловленные черты, а не только интеллект. ', Труды Национальной академии наук США , 111 (2014): 15273-8. doi: 10.1073/pnas.1408777111.